Fu inaugurato il 22 marzo 1609 da p. Domenico di Gesù Maria (Ruzzola) e da p. Ferdinando di S. Maria (Torres Martinez), che vi portò ventinove religiosi e ne prese possesso a nome dell’Ordine. Alcuni frati dimorarono negli anni precedenti nel Castello mentre si costruiva il convento. Fu voluto e fatto costruire dai Principi Doria, Conti di Loano, che ne rimasero proprietari fino al 1935.
Nel 1623 e nel 1626 vi si celebrarono due Capitoli Generali. La vita conventuale si interruppe nel 1794 per l’occupazione francese e non riprese se non nel 1831, sebbene sia quasi sempre rimasto almeno un padre a custodire la chiesa.
Nel 1833 diventò casa di noviziato e lo fu fino al 1964. Nel 1913 p. Emanuele Carattino vi iniziò la pubblicazione dell’Ite ad Ioseph. È monumento nazionale dal 1910. Presso il Monte Carmelo si raduna una fraternità OCDS.